In questo articolo, Orsini e colleghi con Wellmicro hanno indagato l’interazione microbiota-ospite analizzando S100B, una proteina presente nella mucosa intestinale e nelle feci, e le sue potenziali interazioni con proteine prodotte dai microrganismi intestinali. Per fare questo, è stata sviluppata una pipeline bioinformatica che attingeva da dati di interazione di domini proteici conosciuti con dati di proteomica derivati da studi metatassonomici sul microbiota intestinale di soggetti sani o con Inflammatory Bowel Disease (IBD). In questo modo sono state identificate proteine prodotte dal microbiota potenzialmente interagenti con SB100 sia in soggetti sani che affetti da IBD, anche se in quest’ultimo gruppo il numero di proteine interagenti era inferiore rispetto al gruppo dei sani. Questo ha dimostrato come sia importante investigare S100B come candidato a molecola di segnalazione nel macchinario della comunicazione microbiota-intestino.
Orsini, Massimiliano, Rosa di Liddo, Federica Valeriani, Marzia Mancin, Renata D’Incà, Andrea Castagnetti, Antonio Aceti, Pier Paolo Parnigotto, Vincenzo Romano Spica, and Fabrizio Michetti. 2020. ‘In Silico Evaluation of Putative S100B Interacting Proteins in Healthy and IBD Gut Microbiota’. Cells 9 (7). https://doi.org/10.3390/CELLS9071697.